La obra de la gracia santificadora es la de capacitar la voluntad humana para vivir un discipulado responsable, yendo hacia la perfección cristiana del amor.  La santificación (el proceso por el cual es responsable la gracia santificadora) es un proceso de aprender a obedecer a Dios.  Si antes resistíamos a Dios y le desobedecíamos, ahora le buscamos para obedecerlo.  La santificación es un proceso de maduración en el discipulado.  El cristiano es libre de obedecer o desobedecer a Dios.  Esta libertad viene directamente de Dios.  La desobediencia causa una ruptura, aunque temporal, en nuestra relación con Dios.  La obediencia hace más estrecha nuestra relación con Dios.  Cuando desobedecemos a Dios, la gracia vuelve a ofrecernos la oportunidad de obedecerle.  Si le obedecemos, la gracia nos presenta nuevas oportunidades.   El propósito de este proceso es que cultivemos la costumbre o el hábito de escuchar a Dios y obedecerle.  Mientras más practicamos la obediencia, más afinamos el oído y el corazón a la obra del Espíritu Santo, quien nos indica las tareas que nos tocan.  Si constantemente desoímos las indicaciones del Espíritu Santo, nos volvemos primeramente desinteresados y hasta sordos espirituales.